Le complicanze legate al trattamento endopeel sono in genere lievi, e soprattutto transitorie: il più delle volte si limitano alla presenza di edema, specialmente nelle aree più delicate (come quella perioculare) e qualche ecchimosi.
Raramente si osservano edemi tardivi, legati ad allergia specifica alle arachidi; in caso di dubbio, per allontanare questa evenienza è consigliabile effettuare un test preliminare, che tuttavia di solito non è richiesto.